解体を数日後に控えた電気機関車EF5861が、突如姿を消した――。主人公の水原トオルは、地下鉄の駅のホームで消えた電気機関車EF5861に偶然遭遇。するとトオルの身体に異変が起きてしまうのだった。列車とトオル、この二つを結ぶ謎とは一体何なのだろうか……? SF小説作家・山野浩一の「X電車で行こう」を原作に、りんたろうが監督を務めたアニメーション作品。消えた電車・X電車を中心に描かれるSFドタバタコメディは原作から大幅にストーリーがアレンジ。原作ファンも楽しめる内容となっている。
テストで0点を取ってしまった三太郎は、 「昨日に戻ってテストをやり直したい」 とぼやいていた。 そこにねずみ男が現れ 「願いの書いた手紙を鬼太郎に出せ」と たきつける。 手紙を出した三太郎は、 過去を旅する幽霊電車に乗るが、 悪いことをする過去の自分を目にして改心していく。